Sdílené přístroje infrasktruktury
V následujícím seznamu jsou uvedeny ústavy, které poskytují přístup k analytickým přístrojům a dalším zařízením určených pro výzkumné účely.
| Název přístroje | Možnosti využití/analýzy | Případná specifikace |
| Chlazená centrifuga (Sigma 4K15C) | centrifugace vzorků | až 20 tis g, 1,5-2 ml zkumavky, -20 – +40 °C |
| Spektrofotometr se sipperem (AJ Specord 50 Plus) | spektrofotometrická analýza vzorků | kapalné vzorky, rozhraní vlnových délek UV-VIS, sipper s možností nasávání vzorků |
| Mikrodestičkový spektrofotometr (Biotek PowerWave HT) | spektrofotometrická analýza vzorků | 96 jamková destička, inkubace od RT až do 50 °C, snímání na vlnových délkách 200 nm – 999 nm |
| PCR cykler (Biometra Tone grad) | PCR | 96 jamková platforma pro 0,2 ml zkumavky, gradientový blok |
| Autokláv (tuttnauer 2840 EL-D) | autoklávování, sterilizace | autoklávování skla a plastového materiálu, 121 °C/15 min |
| Dokumentační systém (Azure C200) | dokumentace elektroforetických gelů | rozměry desky 200×150 mm, vlnová délka výbojky 254 nm, možnost analýzy i pro VIS a modré světlo |
| Vakuová centrifugační odparka (Labconco CentriVap) | odpařování těkavých látek ze vzorků, vysoušení vzorků | odpařování těkavých látek v centrifuze za vakua, 1,5-2 ml zkumavky |
| Homogenizátor (Bioreba homex) | homogenizace rostlinných vzorků v plastových vacích | homogenizace vzorků na izolaci nukleových kyselin a sérologické metody, rotační hlavice s ložiskovými kuličkami, možnost nastavení intenzity rotace, použití pouze s originálními Bioreba vaky |
| Homogenizátor (Fritsch Pulverisette 2) | homogenizace rostlinných vzorků v keramických miskách | homogenizace vzorků s principem hmoždíř-palička |
| Promývačka mikro destiček (Tecan) | promývání mikro destiček pufrem v přesném sledu, sérologické testy | 16 hrotová hlavice pro formaci destiček 8×12 jamek, možnost nastavení sekvence promývání a objemu promývacího pufru |
| Fluorescenční mikroskop (Leica DM5000B) | mikroskopie biologických preparátů, DAPI fluorescenční mikroskopie barvených preparátů | objektiv 5, 10, 20, 40, 63 a 100 X, snímání kamerou, DAPI fluorescence |
| Robotizovaná binokulární lupa (Zeiss Stereo) | snímání makro preparátů, časosběrné snímání, z-stack – snímání různých hloubek a tvorba kompozitního ostrého obrazu | objektiv 0,5 a 1,5 X, snímání kamerou, externí osvětlení, robotizace a software na zpracování snímků |
| Kryostat (Leica Cm1860 UV) | příprava biologických preparátů na mikroskopování | UVC sterilizace, zmrazení vzorku až na -40 °C, nastavitelná tloušťka řezů 1-100 µm, max. rozměr vzorku 5×8 cm |
| Chlazený sklad | skladování velkoobjemového zboží (ovoce a zelenina) při nízkých teplotách | počítačem řízená teplota, skladování při teplotách 1-10 °C |
| Colorimeter (Konica Minolta CR-400) | kolorimetrie, zaznamenávání barevných škál, rozdílu v hodnotách a analýza PASS/FAIL | přenosný kolorimetr; průměr snímané plochy 8 mm; zaznamenávání L*a*b*, XYZ a Yxy |
| Refraktometr (Kruss AR4D) | stanovení koncentrace refraktometrické sušiny v roztocích | % Brix |
| Polarimetr (Kruss P1000-led) | stanovení koncentrace cukrů v roztocích |
| Název přístroje | Možnosti využití/analýzy | Případná specifikace |
| Drtič /střižný mlín | drcení a homogenizace pevných surovin na požadovanou frakci | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Briketovací lis | výroba briket (biopaliv) s podílem různých vstupních surovin | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Peletovací lis | výroba pelet (krmiv, biopaliv, hnojiv) | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Muflovací pec | žíhání hmoty teplotou až 1200 °C | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Kalorimetr | stanovení spalného tepla u pevných biopaliv | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Spalovací zařízení biopaliv | analýza spalin, popelu a celkově spalovacího procesu u tuhých biopaliv | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Termokamera | optotermokamera – snímání teploty na dálku včetně obrazu | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Sýtovací zařízení | sítová analýza frakcí suchou i mokrou cestou dle různých norem | individuální domluva na vhodnosti použití |
| CO2 Analyzátor | měření emisí CO2 z půdy, kompostu – dlouhodobá měření, nebo okamžitá měření | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Infiltrometr | měření infiltrace vody do půdy, vlhkost půdy, kapacita atd. | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Penetrometr | měření penetrační odporu půdy | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Oedometr | měření únosnosti a stability půdy a pevnosti materiálů při zatěžování | individuální domluva na vhodnosti použití |
| AAS | analýza vybraných prvků (dle aktuálních lamp) | individuální domluva na vhodnosti použití |
| Název přístroje | Možnosti využití/analýzy | Případná specifikace |
| Sušárna EST 03S | sušení vzorků při 25 – 70 °C | velkoobjemová |
| Mikrovlnný rozklad | extrakce a rozklad vzorků | 15 (až 44) vzorků současně |
| Digitální mikroskop Keyence | analýzy povrchů, až 5000x | |
| Konfokální mikroskop | fluorescenční a laserový | 100-630x |
| Oximetr | obsah kyslíku vzduch, roztok | |
| HPLC | analýza látek | |
| Coulometr | analýza těžkých kovů v ppb limitu | |
| Chladicí box | cc 2-10°C | objem cca 10 m3 |
| Izotachoforéza | analýza polárních látek | rutinně K,Na,Ca,Mg, lze polární látky |
| Název přístroje | Možnosti využití/analýzy | Případná specifikace |
| Listový porometr | měření výměny plynů | |
| N-pen | měření obsahu dusíku v listech | |
| Spectrapen I | měření intenzity světla a kvality spektrálního světla | |
| Spectrapen II | měření intenzity světla a kvality spektrálního světla | |
| Plantpen | měření normalizovaného diferenčního vegetačního indexu (NDVI) | |
| Stereomikroskop SZX7 | stereomikroskop |
| Název přístroje | Možnosti využití/analýzy | Případná specifikace |
| GC-MS | vybrané těkavé látky | |
| HPLC-UV/VIS | organické kyseliny, sacharidy, polyfenoly | |
| Kolorimetr | stanovení barevných parametrů povrchu i kapalin | |
| Spektrofotometr | antioxidační kapacita, obsah veškerých polyfenolů | |
| Lyofilizátor | sušení vzorků, surovin pomocí lyofilizace | |
| Horkovzdušná sušička | sušení vzorků, surovin do 250 °C s nastavitelným teplotním gradientem |
| Název přístroje | Možnosti využití/analýzy | Případná specifikace |
| Automatická počítačka kolonií | počítání kolonií mikroorganismů | |
| Elektroforetické a transluminační zařízení | separace vybraných látek | |
| Fotometr UV-VIS dvoupaprskový | skenovací fotometr | |
| Mikrodestičkový fotometr | růstové křivky MO, identifikace vybraných MO v rámci Entero-testů, Neferm-testu, staphy-testu, strepto-testu, candida-testu. Vybrané MO čeledi Enterobacteriaceae a Vibrionaceae, Aeromonas, , kvasinek, G+ kataláza negativní/pozitivní koky | 96 jamková destička, temperovaný, snímání na vlnových délkách 405, 450, 540, 560, 580, 620 a 690 nm |
| Chlazená centrifuga | centrifugace vzorků | až 18 tis. ot/min, Až 25 ml vzorku,-20 – +40 ° C |
| HPLC-UV/VIS | organické kyseliny (k. vinná, jablečná), sacharidy (glucosa, fructosa, saccharosa), vybrané antioxidanty (k. gallová, protocatechuová, 4-hydroxybenzoová, vanillová, syringová, kávová, kumarová, ferulová, catechin, epicatechin, rutin, myricetin, trans-piceatanol, tyrosil, anthokyany) | |
| GC-MS | volatilní látky ve víně, moštu; silice | |
| HPLC-MS | jednotlivé fenolické látky, dusíkaté látky-aminokyseliny | nutná konzultace |
| Miura – plně automatizovaný spektrofotometr | spektrofotometrická stanovení – antioxidační aktivita (metoda DPPH, FRAP), celkový obsah fenolických látek, stanovení jednotlivých forem asimilovatelného dusíku v moštu a ve víně (alfa aminokyseliny a amonné ionty), polyfenoloxidáza, prolin, arginin, anthokyany | |
| Alpha – FTIR analyzátor | základní analytické parametry moštu a vína (cukry, alkohol, kyselina vinná, kyselina octová,…) | |
| Gibertiny – automatizované destilační zařízení | stanovení alkoholu, extraktu, těkavých kyselin, hustoty | |
| Mikrobiologická stanovení v moštu a víně | určení mikrobiální stability vína | |
| Vakuová odparka | zahuštění roztoků | |
| Scanovací pektrofotometr | spektrální analýzy |
| Název přístroje | Možnosti využití/analýzy | Případná specifikace |
| Dron Matrice 210 s multispektrální kamerou Sequoia a optickou kamerou DJI Zenmuse X5S | tvorba leteckých snímků, ortofotomap a 3D modelů fotogrammetrickou metodou, multispektrální snímkování | Specifikace Multispektrální kamera: 4 spektra Green (550 BP 40) Red (660 BP 40) Red Edge (735 BP 10) Near infrared (790 BP 40) Specifikace optická kamera: Rozlišení foto 20,8 MP 4k video 60 fps Velikost čipu CMOS, 4/3 Objektivy s ohniskovou vzdáleností 24 mm a 50 mm, světelností f2 resp. f1,7 |
| Výkonné PC optimalizováno pro fotogrammetrické výpočty | tvorba ortofotomap, multispektrálních map včetně vegetačních indexů a 3D modelů fotogrammetrickou metodou | Software Pix4D, 12 jader, 8GB grafická karta, 64 GB RAM |
| 3D tiskárna Průša MK2S | tvorba 3D modelů | Tisková plocha 20x20x20 cm |
| LaserCutter, Nova 51 | modelování, řezání: dýha, lepenka, překližka | pracovní plocha 130x90cm, výkon trubice 130 W |
| Název přístroje | Možnosti využití/analýzy | Případná specifikace |
| Destičkový reader-spektrofotometr (UV-Vis) | měření koncentrace nukl. kyselin, OD, růstové křivky | měření koncentrace nukl. Kyselin, OD, růstové křivky |
| Destičkový reader-fluorimetrie, luminiscence | měření koncentrace nukl. kyselin, OD, růstové křivky, spefifické analýzy mikroorganismů s inteagujícím fluorescenčním/luminiscenčním barvivem dokumentujícím růst mikroorganismů např. v interakci s nanočásticemi | měření koncentrace nukl. Kyselin, OD, růstové křivky, spefifické analýzy mikroorganismů s inteagujícím fluorescenčním/luminiscenčním barvivem dokumentujícím růst mikroorganismů např. v interakci s nanočásticemi |
| Diditální mikroskop Keyence vhx 6000 | mikroskopické snímky analyzovaných vzorků | mikroskopické snímky analyzovaných vzorků |
| Sekvenátor druhé generace, MniSeq | SBS technologie, metagenomika, amplikonové sekvenování, RNA sekvenace | SBS technologie, metagenomika, amplikonové sekvenování, RNA sekvenace |
| Real-time PCR cykler, Rotor-Gene 3000 | kvantifikace DNA/RNA ve vzorku | kvantifikace DNA/RNA ve vzorku |
| Kapilární elektroforéza abi prism 310 | fragmentační analýzy, sekvenování | fragmentační analýzy, sekvenování |
| Real-time PCR cykler, destičkový, qTower | kvantifikace DNA/RNA ve vzorku | 96 vzorků/run |
| Mikroskop Nikon Ni-L | mikroskopie spor hub a bakterií | primárně pokročilé fotografie rozmnožovacích orgánů hub |