Zakázkové testování patogenních mikroorganismů
 

Reakce PCR pro detekci bakterie X. euvesicatoria

Patogenní organismus: Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas perforans

Choroba: Bakteriální tečkovitost rajčat a paprik, BSX (Bacterial spot causing xanthomonads)

Hostitelé: rajče (Solanum lycopersicum), paprika (Capsicum annuum)

Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva.


Reakce Real-time PCR pro detekci bakterie P. amygdali pv. lachrymans

Patogenní organismus: Pseudomonas amygdali pv. lachrymans

Choroba: Bakteriální skvrnitost okurky

Hostitelé: okurka (Cucumis sativus), tykvovité (Cucurbitaceae – tykev, meloun aj.)

Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva.


Reakce Real-time PCR pro detekci bakterií Cmm, Pst a BSX

- Reakce simplex Real-time PCR i multiplex Real-time PCR

Patogenní organismus: Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis, Pseudomonas syringae pv. tomato, Bacterial spot-causing organisms (Xanthomonas euvesicatoria, X. vesicatoria, X. gardneri, X. perforans)

Hostitelé: rajče (Solanum lycopersicum) – Cmm, Pst, BSX; paprika (Capsicum annuum) ‑ BSX

Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva.

 

Reakce Real-time PCR pro detekci bakterie X. hortorum pv. carotae

Patogenní organismus: Xanthomonas hortorum pv. carotae

Choroba: bakteriální spála mrkve

Hostitelé: čeleď miříkovité

Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva

 

Reakce Real-time PCR pro detekci bakterie Pseudomonas syringae pv. apii

Patogenní organismus: Pseudomonas syringae pv. apii

Choroba: bakteriální listová skvrnitost celeru

Hostitelé: čeleď miříkovité, zejména celer bulvový (Apium graveolens var. rapaceum), celer řapíkatý (Apium graveolens var. dulce)

Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva

 

Reakce Real-time PCR pro detekci hub S. apiicola a P. libanotidis

Reakce simplex Real-time PCR i multiplex Real-time PCR

Patogenní organismus: Septoria apiicola, Pleodomus libanotidis

Choroba: tečkovitost listů celeru, hnědá hniloba kořenové zeleniny

Hostitelé: čeleď miříkovité, především celer (Apium graveolens var. rapaceum, Apium graveolens var. dulce)

Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva

 

Identifikace bakterie Candidatus L. solanacearum masivně paralelním sekvenováním

Reakce HTS (High Throughput Sequencing) – detekce a rozlišení haplotypu bakterie

Patogenní organismus: Candidatus Liberibacter solanacearum

Choroba: známá pod anglickým názvem „zebra chip“

Hostitelé: čeleď miříkovité, lilkovité (zejména brambor)

Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva

 

Dostupné kultury mikroorganismů


 

Kontakt

Ing. Aleš Eichmeier, Ph.D.

ales.eichmeier@mendelu.cz