Zakázkové testování patogenních mikroorganismů
Reakce PCR pro detekci bakterie X. euvesicatoria
Patogenní organismus: Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas perforans
Choroba: Bakteriální tečkovitost rajčat a paprik, BSX (Bacterial spot causing xanthomonads)
Hostitelé: rajče (Solanum lycopersicum), paprika (Capsicum annuum)
Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva.
Reakce Real-time PCR pro detekci bakterie P. amygdali pv. lachrymans
Patogenní organismus: Pseudomonas amygdali pv. lachrymans
Choroba: Bakteriální skvrnitost okurky
Hostitelé: okurka (Cucumis sativus), tykvovité (Cucurbitaceae – tykev, meloun aj.)
Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva.
Reakce Real-time PCR pro detekci bakterií Cmm, Pst a BSX
- Reakce simplex Real-time PCR i multiplex Real-time PCR
Patogenní organismus: Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis, Pseudomonas syringae pv. tomato, Bacterial spot-causing organisms (Xanthomonas euvesicatoria, X. vesicatoria, X. gardneri, X. perforans)
Hostitelé: rajče (Solanum lycopersicum) – Cmm, Pst, BSX; paprika (Capsicum annuum) ‑ BSX
Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva.
Reakce Real-time PCR pro detekci bakterie X. hortorum pv. carotae
Patogenní organismus: Xanthomonas hortorum pv. carotae
Choroba: bakteriální spála mrkve
Hostitelé: čeleď miříkovité
Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva
Reakce Real-time PCR pro detekci bakterie Pseudomonas syringae pv. apii
Patogenní organismus: Pseudomonas syringae pv. apii
Choroba: bakteriální listová skvrnitost celeru
Hostitelé: čeleď miříkovité, zejména celer bulvový (Apium graveolens var. rapaceum), celer řapíkatý (Apium graveolens var. dulce)
Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva
Reakce Real-time PCR pro detekci hub S. apiicola a P. libanotidis
Reakce simplex Real-time PCR i multiplex Real-time PCR
Patogenní organismus: Septoria apiicola, Pleodomus libanotidis
Choroba: tečkovitost listů celeru, hnědá hniloba kořenové zeleniny
Hostitelé: čeleď miříkovité, především celer (Apium graveolens var. rapaceum, Apium graveolens var. dulce)
Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva
Identifikace bakterie Candidatus L. solanacearum masivně paralelním sekvenováním
Reakce HTS (High Throughput Sequencing) – detekce a rozlišení haplotypu bakterie
Patogenní organismus: Candidatus Liberibacter solanacearum
Choroba: známá pod anglickým názvem „zebra chip“
Hostitelé: čeleď miříkovité, lilkovité (zejména brambor)
Zdrojovým materiálem testování může být jakýkoliv rostlinný materiál včetně osiva
Dostupné kultury mikroorganismů
Kontakt
Ing. Aleš Eichmeier, Ph.D.