| Ústav biotechniky zeleně | DG18P02OVV007 – Opomíjená témata krajinářské architektury pro potřeby památkové péče | MK | NAKI | 2018-2022 |
| Ústav plánování krajiny | DG18P02OVV018 – Poplužní dvory Čech, Moravy a Slezska a jejich harmonická kulturní krajina – identifikace a soudobá interpretace kulturních hodnot | MK | NAKI | 2018-2022 |
| Ústav biotechniky zeleně | DG18P02OVV044 – Zahradně-architektonická tvorba v období totalitních režimů v letech 1939–1989 na území České republiky | MK | NAKI | 2018-2022 |
| Ústav vinohradnictví a vinařství | TH04030522 – Využití teplotního monitorování v prognóze a ochraně proti padlí révy | TA ČR | 2019-2022 |
Ústav posklizňové technologie zahradnických
produktů | QK1910264 – Potraviny s vysokým obsahem sulforafanu | MZe | NAZV | 2019-2022 |
| Ústav zelinářství a květinářství | 8J20PL033 – Vliv biodiverzity mikroorganismů na ochranu půdy v zemědělském pěstebním systému | MŠMT | 2020-2022 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | EF16_017/0002334 – Výzkumná infrastruktura pro mladé vědce | MŠMT | 2017-2021 |
| Ústav ovocnictví | QK1920058 – Inovace integrované produkce teplomilného ovoce se zaměřením na zdravotní stav produkčních výsadeb a rozmnožovacího materiálu peckovin | MZe | 2019-2021 |
| Ústav ovocnictví | QK1920124 – Identifikace příčin předčasného odumírání a jeho omezení při pěstování meruněk v ČR | MZe | 2019-2021 |
| Ústav vinohradnictví a vinařství | TH03030366 – Možnosti využití metod precizního zemědělství pro detekci komplexu chorob kmínku révy vinné | TA ČR | 2018-2021 |
| Ústav plánování krajiny | TITBMMR805 – Vymezování zelené infrastruktury v územně plánovací dokumentaci, zejména v územním plánu, jako nástroj posilování ekosystémových služeb v území | TA ČR | 2019-2021 |
| Mendeleum – ústav genetiky | TJ02000096 – Metagenomický průzkum zdravotního stavu vinohradů a využití GTD antagononistů čeledi Pseudonocardiaceae | TA ČR | 2019-2021 |
| Mendeleum – ústav genetiky | TJ02000356 – Vývoj detekčních systémů patogenních organismů zelenin čeledi Apiaceae molekulárně biologickými metodami | TA ČR | 2019-2021 |
| Ústav šlechtění a množení zahradnických rostlin | VH20202021052 – Stanovení metod hodnocení městského klimatu, zvláště tepelného ostrova, určení postupů a návrh opatření pro omezení negativních dopadů meteorologických extrémů na obyvatele a životní prostředí, zejména ve velkých městských aglomeracích | MV | 2020-2021 |
| Ústav zahradní a krajinářské architektury | DG16P02H053 – České zahradní umění a krajinářská architektura v kontextu evropského vývoje | MK | 2016-2020 |
| Ústav plánování krajiny | DG16P02M034 – Identifikace a prezentace památkového potenciálu historické kulturní krajiny České republiky | MK | 2016-2020 |
| Ústav vinohradnictví a vinařství | DG16P02R017 – Vinohradnictví a vinařství pro zachování a obnovu kulturní identity vinařských regionů na Moravě (2016 – 2020) | MK | 2016-2020 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | LTC18002 – Vývoj nových materiálů vhodných pro 3D tisk s antimikrobiálními vlastnostmi (3D ANTIMICROB) | MŠMT | 2018-2020 |
| Mendeleum – ústav genetiky | LTC18009 – Nové přístupy pro snižování negativních hospodářských dopadů rostlinných patogenů rodu Xanthomonas | MŠMT | 2018-2020 |
| Ústav šlechtění a množení zahradnických rostlin | TH02030073 – Revitalizace zemědělské půdy v oblastech ČR ohrožených suchem | TA ČR | 2017-2020 |
| Ústav vinohradnictví a vinařství | TH02030280 – Spontánní fermentace ve výrobě vína jako řiditelná technologie | TA ČR | 2017-2020 |
| Ústav zahradnické techniky | TH02030467 – Vývoj a ověření zařízení pro hloubkové zapravení organické hmoty do půdy ve vinicích a sadech | TA ČR | 2017-2020 |
Ústav posklizňové technologie zahradnických
produktů | TH02030620 – Využití réví pro výzkum a vývoj pomocné látky pro ekologickou ochranu rostlin | TA ČR | 2017-2020 |
| Mendeleum – ústav genetiky | TJ01000274 – Vývoj detekčních systémů patogenních bakterií rajčat, paprik a okurek molekulárně biologickou metodou Real Time PCR | TA ČR | 2018-2019 |
| Ústav zelinářství a květinářství | 7AMB16PL001 – Fyziologické změny rodu Salvia spp. způsobené chladovým stresem | MŠMT | 2017-2018 |
| Ústav ovocnictví | QJ1510081 – Inovace klíčových technologických postupů školkařské výroby ovocných výpěstků | MZe | 2015-2018 |
| Mendeleum – ústav genetiky | QJ1510088 – Využití moderních biotechnologických postupů pro zvýšení produkce a kvality zelenin rodu Brassica L. v celé vertikále od šlechtění, přes pěstování až po skladování produktu | MZe | 2015-2018 |
| Ústav ovocnictví | QJ1510352 – Hodnocení faktorů ovlivňujících škodlivost fytoplazem napadajících ovocné dřeviny a ověřování účinných prostředků jejich eliminace | MZe | 2015-2018 |
| Ústav ovocnictví | QJ1610186 – Přenos rezistence z GM odrůdy švestky ´HoneySweet´ do odrůdy ´Domácí velkoplodá´, hodnocení transgenní a netransgenní rezistence slivoní k viru šarky švestky | MZe | 2016-2018 |
| Ústav ovocnictví | QJ1630301 – Tvorba nových systémů biotechnologických opatření pro zachování a rozvoj biodiverzity zemědělských plodin a lesních dřevin (2016 – 2018) | MZe | 2016-2018 |
| Ústav biotechniky zeleně | DF13P01OVV003 – Zahradně-architektonická tvorba v kontextu realizace cílů národního obrození během 1. Československé republiky | MK | 2013-2017 |
| Mendeleum – ústav genetiky | LD14051 – Vývoj spolehlivého systému pro detekci a kvantifikaci patogenů způsobujících onemocnění kmínků révy a mapování výskytu tohoto onemocnění v ČR | MŠMT | 2017-2017 |
| Mendeleum – ústav genetiky | LD15163 – Použití next generation sequencing pro diagnostiku virových a virům podobných chorob révy vinné | MŠMT | 2016-2017 |
| Ústav vinohradnictví a vinařství | TA04020464 – Různé způsoby ozeleňování a ošetřování vinohradů a jejich vliv na omezení eroze a kvalitu produkce | TA ČR | 2014-2017 |
| Ústav vinohradnictví a vinařství | TA04021402 – Vývoj přírodních preparátů na ochranu révy vinné proti houbovým patogenům | TAČR | 2014-2017 |
Ústav posklizňové technologie zahradnických
produktů | LD14038 – Zhodnocení odpadů z vinohradnictví a vinařství na biologicky aktivní látky (2014 – 2016) | MŠMT | 2014-2016 |
| Ústav ovocnictví | QJ1210036 – Rozšíření sortimentu podnoží jádrovin a odrůd hrušní o nové, perspektivní podnože a netradiční asijské odrůdy hrušní odvozené od Pyrus pyrifolia NAKAI. a Pyrus ussuriensis MAXIM. | MZe | 2012-2016 |
| Mendeleum – ústav genetiky | QJ1210175 – Výzkum a vývoj standardních metodických postupů ozdravování ovocných dřevin a révy vinné pomocí chemoterapie in vitro kultur pro systém certifikace zdravotního stavu výsadbového materiálu. (2012 – 2016) | MZe | 2012-2016 |
Ústav posklizňové technologie zahradnických
produktů | QJ1210258 – Extrakce lignanů z dřevní hmoty a jejich využití v doplňcích stravy s významnými biologickými účinky (2012 – 2016) | MZe | 2012-2016 |
Ústav posklizňové technologie zahradnických
produktů | QJ1210275 – Řešení aktuálních problémů pěstování třešní a višní s tržní kvalitou plodů se zaměřením na ekologicky šetrné postupy (2012 – 2016) | MZe | 2012-2016 |
| Ústav šlechtění a množení zahradnických rostlin | DF11P01OVV006 – Záchrana a konzervace kulturního dědictví historických českých a moravských odrůd ovoce a dalších tradičních a zapomenutých plodin | MK | 2011-2015 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | DF11P01OVV019 – Metody a nástroje krajinářské architektury pro rozvoj území | MK | 2011-2015 |
| Ústav plánování krajiny | DF12P01OVV001 – Ochrana a péče o historickou kulturní krajinu prostřednictvím institutu krajinných památkových zón | MK | 2012-2015 |
| Ústav zelinářství a květinářství | LH12196 – Rozvoj metod a studia stresového metabolismu a genomiky v Číně a České republice | MŠMT | 2012-2015 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | TA02020544 – Biologická aditiva zálivkové vody pro zvýšení kvality potravinových plodin | TA ČR | 2012-2015 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | EE2.3.30.0017 – Postdoktorandi v oborech biologických věd na MENDELU | MŠMT | 2012-2014 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | EE2.4.31.0089 – Partnerské sítě pro zahradnictví a krajinářskou architekturu (2012 – 2014) | MŠMT | 2012-2014 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QI101A123 – Komplexní výzkum rezistence transgenních rostlin Prunus domestica L., klon C5 k viru šarky švestky, viru zakrslosti slivoně a viru chlorotické skvrnitosti jabloně, identifikace netransgenních zdrojů rezistence slivoně k PPV. | MZe | 2010-2014 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QI111A141 – Výzkum nových technologií v pěstování angreštu a rybízu se zaměřením na kvalitu a využití plodů | MZe | 2011-2014 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QI111B107 – Výzkum získávání a využití biologicky aktivních látek (BAL) ze semen vinných hroznů pro zlepšení metabolismu hospodářských zvířat jako podklad pro návrh nejlepší dostupné techniky (BAT) | MZe | 2011-2014 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QI112A138 – Lokální identita zeleně venkovských sídel | MZe | 2011-2014 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | LH11134 – Taxonomické, evoluční a fytochemické otázky komplexu Lonicera kamtschatica/coerulea jako genetického zdroje nového ovoce a potřeby jeho in situ konzervace | MŠMT | 2011-2013 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QI91A032 – Výběr rezistentních genotypů meruněk k PPV s tržní kvalitou plodů | MZe | 2009-2013 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QI91B094 – Odrůdové hroznové šťávy se zdravotním benefitem | MZe | 2009-2013 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | 7E08071 – Sharka Containment | MŠMT | 2008-2012 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | GA522/09/1565 – Vývoj metodologické a technologické platformy pro optický monitoring biotického stresu a obsahu fenolických látek u révy vinné | GA ČR | 2009-2012 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | GAP206/10/0625 – Kondenzované anthokyaniny – analýza, příprava, (bio)transformace a možnosti využití | GA ČR | 2010-2012 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | ME10107 – Česko-čínská vědeckovýzkumná spolupráce v oblasti šlechtění a introdukce odrůd rodu Prunus | MŠMT | 2010-2012 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QH81110 – Zvýšení odolnosti zeleniny k vodnímu stresu | MZe | 2008-2012 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QH81142 – Sloupcové jabloně s odolností proti chorobám | MZe | 2008-2012 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QH81200 – Optimalizace vodního režimu v krajině a zvýšení retenční schopnosti krajiny uplatněním kompostů z biologicky rozložitelných odpadů na orné půdě i trvalých travních porostech | MZe | 2008-2012 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QH81235 – Vybrané problémy pěstitelských systémů slivoní, rozšířené o skladování plodů | MZe | 2008-2012 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QH82231 – Produkce jahod v ekologických systémech pěstování | MZe | 2008-2012 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QH82232 – Výzkum opomíjených ovocných druhů a jejich začlenění do agrárního sektoru | MZe | 2008-2012 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | 2B08020 – Modelový projekt zamezení biologické degradace půd v podmínkách aridního klimatu | MŠMT | 2008-2011 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QH71172 – Identifikace kmenů a ras strupovitosti (Venturia inaequalis Cke. Wint) | MZe | 2007-2011 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QH71228 – Ozdravení domácích genotypů česneku za účelem jejich uchování metodou kryokonzervace | MZe | 2007-2011 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QH91153 – Využití in vitro kultur k ozdravení odrůd ovocných dřevin a révy vinné od virů, fytoplazem a karanténních patogenů pro systém certifikace výsadbového materiálu včetně ověřování kvality | MZe | 2009-2011 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QH91214 – Nové biotechnologické postupy pro navození rezistence podnoží révy vinné proti nepovirům | MZe | 2009-2011 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | WD-57-07-1 – Možnosti řešení disparit mezi vybranými regiony | MMR | 2007-2011 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | 1G58071 – Integrovaná produkce třešní a višní | MZe | 2005-2009 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | OC 116 – Vliv stresu indukovaného při manipulacích in vitro a termoterapii na genetické a epigenetické změny genomu révy vinné | MŠMT | 2006-2009 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QG60083 – Konkurenceschopnost bioenergetických produktů | MZe | 2006-2009 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | QG60123 – Výzkum a inovace postupů diagnostiky hospodářsky významných, regulovaných a karanténních fytopatogenních organismů pro systém certifikace ovocných dřevin s důrazem na molekulární metody | MZe | 2006-2009 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | 1G57004 – Komplexní metodické zabezpečení údržby trvalých trávních porostů pro zlepšení ekologické stability v zemědělské krajině se zaměřením na oblasti se specifickými podmínkami | MZe | 2005-2008 |
| Zahradnická fakulta MENDELU | GA525/06/1757 – Polyfenolické látky hroznů, révových vín a jejich antimutagenní a antioxidační vlastnosti | GA ČR | 2006-2008 |
